Cały projekt zakłada wydanie siedemdziesięciu tomów serii. Przygotowując podział zbioru na tomy, oparliśmy się o wzorcowe wydania dzieł św. Tomasza z Akwinu. Nawiązując do prac specjalistów z Europy Zachodniej, zamierzona seria będzie ułożona według podziału logicznego: najbardziej znaczące i obszerne dzieła (sumy i komentarze do Sentencji) będą stanowić pierwsze tomy serii, kolejne prace będą klasyfikowane według gatunku (kwestie dyskutowane, komentarze do dzieł Arystotelesa, do Biblii, dzieła mniejsze) oraz doniosłości..
I. Syntezy teologiczne
Tomy 1–11: Księga o Sentencjach Piotra Lombarda
Tomy 12–14: Summa przeciw poganom
II. Kwestie dyskutowane
Tomy 25–27: Kwestie dyskutowane o prawdzie
Tomy 28–29: Kwestie dyskutowane o mocy Boga
Tomy 30–31: Kwestie dyskutowane o złu
Tom 32: Mniejsze kwestie dyskutowane
Kwestia dyskutowana o stworzeniach duchowych
Kwestia dyskutowana o zjednoczeniu Słowa wcielonego
Tom 33: Kwestie dyskutowane o cnotach
Tom 34: Kwestie kwodlibetalne:
III. Dzieła mniejsze
Tom 35: Dzieła mniejsze: pisma polemiczne
Tom 36: Dzieła mniejsze: traktaty
Tom 37: Dzieła mniejsze: listy i opinie naukowe
IV. Komentarze do Arystotelesa
Tom 38: Objaśnienie O niebie i świecie; Objaśnienie O powstawaniu i ginięciu
Tomy 39–40: Objaśnienie Fizyki; Objaśnienie Meteorologiki
Tomy 41–42: Objaśnienie Etyki; Tablica do Etyki
Tom 44: Wykład Hermeneutyki; Wykład Analityk wtórych
Tom 45: Objaśnienia pism antropologicznych
Tomy 46–47: Objaśnienie Metafizyki
V. Inne komentarze
Tom 48: Wykłady dzieł Boecjusza i pism neoplatońskich
VI. Komentarze do Pisma Świętego
Tom 49: Wykład ad litteram Księgi Hioba
Tom 50: Wykład ad litteram Księgi Izajasza
Tom 51: Wykład Księgi Jeremiasza
Tomy 52–53: Catena aurea do Ewangelii Mateusza
Tom 54: Catena aurea do Ewangelii Marka
Tom 55: Catena aurea do Ewangelii Łukasza
Tom 56: Catena aurea do Ewangelii Jana
Tomy 57–58: Postylla do Psalmów
Tomy 59–60: Wykład Ewangelii Mateusza
Tomy 61–63: Wykład Ewangelii Jana
Tom 64: Wykład listów św. Pawła: List do Rzymian
Tom 65: Wykład listów św. Pawła: listy do Koryntian
Tom 66: Wykład listów św. Pawła: listy do Galatów, do Efezjan, do Filipian
Tom 67: Wykład listów św. Pawła:
Wykład Pierwszego Listu do Tesaloniczan
Wykład Drugiego Listu do Tesaloniczan
Wykład Pierwszego Listu do Tymoteusza
Wykład Drugiego Listu do Tymoteusza
Tom 68: Wykład listów św. Pawła: List do Hebrajczyków
VII. Dzieła liturgiczne, wykłady, modlitwy, kazania
Tom 69: Dzieła liturgiczne, wykłady, modlitwy
Tom 70: Kazania